Após vários ciclos de produção e lavagens ineficazes, muitas vezes ocorre uma redução no fluxo do dreno do soro devido ao bloqueio dos microfuros por contaminações orgânicas mistas que, com o tempo, evoluem para biofilmes. O bloqueio dos microporos devido ao biofilme causa problemas tecnológicos na produção de queijo, tanto em termos de modelagem e maturação quanto de contaminação fúngica na casca.